checkpoint
[anneal.git] / src / Geom.java
1 import java.awt.*;
2 import java.util.*;
3 import java.awt.event.*;
4 import javax.swing.*;
5 import javax.media.opengl.*;
6 import javax.media.opengl.glu.*;
7 import edu.wlu.cs.levy.CG.KDTree;
8
9 public class Geom implements Iterable<Geom.T> {
10
11     private KDTree kd = new KDTree(3);
12
13     public static float EPSILON = (float)0.0001;
14     public static Random random = new Random();
15
16     private HashMap<P,P>  ps = new HashMap<P,P>();
17     public  HashSet<E>    es = new HashSet<E>();
18     public  ArrayList<T>  ts = new ArrayList<T>();
19
20     public Iterator<T> iterator() { return ts.iterator(); }
21
22     public P origin() { return newP(0, 0, 0); }
23
24     public Geom score_against = null;
25     public double score = 0;
26     public float score() {
27         return (float)score;
28     }
29
30     public float rescore() {
31         int num = 0;
32         double dist = 0;
33         HashSet<P> done = new HashSet<P>();
34         for(T t : ts)
35             for(P p : new P[] { t.p1(), t.p2(), t.p3() }) {
36                 if (done.contains(p)) continue;
37                 done.add(p);
38                 p.rescore();
39             }
40         for(T t : ts)
41             for(P p : new P[] { t.p1(), t.p2(), t.p3() })
42                 p.kdremove();
43         kd = new KDTree(3);
44         for(T t : ts)
45             for(P p : new P[] { t.p1(), t.p2(), t.p3() })
46                 p.kdinsert();
47         return (float)(dist/num);
48     }
49
50     public void transform(M m) {
51         ArrayList<P> set = new ArrayList<P>();
52         set.addAll(ps.keySet());
53         for(P p : set) p.transform(m);
54     }
55
56     public Vec diagonal() {
57         float min_x = Float.MAX_VALUE;
58         float min_y = Float.MAX_VALUE;
59         float min_z = Float.MAX_VALUE;
60         float max_x = Float.MIN_VALUE;
61         float max_y = Float.MIN_VALUE;
62         float max_z = Float.MIN_VALUE;
63         for(P p : ps.keySet()) {
64             if (p.x < min_x) min_x = p.x;
65             if (p.y < min_y) min_y = p.y;
66             if (p.z < min_z) min_z = p.z;
67             if (p.x > max_x) max_x = p.x;
68             if (p.y > max_y) max_y = p.y;
69             if (p.z > max_z) max_z = p.z;
70         }
71         return new Vec(max_x - min_x, max_y - min_y, max_z - min_z);
72     }
73
74     public P centroid() {
75         float min_x = Float.MAX_VALUE;
76         float min_y = Float.MAX_VALUE;
77         float min_z = Float.MAX_VALUE;
78         float max_x = Float.MIN_VALUE;
79         float max_y = Float.MIN_VALUE;
80         float max_z = Float.MIN_VALUE;
81         for(P p : ps.keySet()) {
82             if (p.x < min_x) min_x = p.x;
83             if (p.y < min_y) min_y = p.y;
84             if (p.z < min_z) min_z = p.z;
85             if (p.x > max_x) max_x = p.x;
86             if (p.y > max_y) max_y = p.y;
87             if (p.z > max_z) max_z = p.z;
88         }
89         return new P((float)(max_x + min_x)/2,
90                      (float)(max_y + min_y)/2,
91                      (float)(max_z + min_z)/2);
92     }
93
94     public P newP(double x, double y, double z) { return newP((float)x, (float)y, (float)z); }
95     public P newP(float x, float y, float z) { return new P(x, y, z); }
96     
97     public T newT(P p12, P p23, P p31, Vec norm) {
98         Vec norm2 = p31.minus(p12).cross(p23.minus(p12));
99         float dot = norm.dot(norm2);
100         //if (Math.abs(dot) < EPSILON) throw new Error("dot products within epsilon of each other: "+norm+" "+norm2);
101         if (dot < 0) { P p = p12; p12=p23; p23 = p; }
102         return newT(p12, p23, p31);
103     }
104
105
106     public float volume() {
107         double total = 0;
108         for(T t : ts) {
109             double area = t.area();
110             Vec origin_to_centroid = new Vec(newP(0, 0, 0), t.centroid());
111             boolean facingAway = t.norm().dot(origin_to_centroid) > 0;
112             double height = Math.abs(t.norm().dot(origin_to_centroid));
113             total += ((facingAway ? 1 : -1) * area * height) / 3.0;
114         }
115         return (float)total;
116     }
117
118     public P nearest(P p) {
119         Object[] results;
120         try { results = kd.nearest(new double[]{p.x,p.y,p.z},1); } catch (Exception e) { throw new Error(e); }
121         return (P)results[0];
122     }
123
124     public T newT(P p1, P p2, P p3) {
125         p1 = p1.register();
126         p2 = p2.register();
127         p3 = p3.register();
128         E e12 = p1.makeE(p2);
129         E e23 = p2.makeE(p3);
130         E e31 = p3.makeE(p1);
131         while(e12.next != e23 || e23.next != e31 || e31.next != e12) {
132             e12.makeAdjacent(e23);
133             e23.makeAdjacent(e31);
134             e31.makeAdjacent(e12);
135         }
136         T ret = e12.makeT();
137         if (e12.t == null) throw new Error();
138         if (e23.t == null) throw new Error();
139         if (e31.t == null) throw new Error();
140         return ret;
141     }
142
143     public M aspect = new M();
144     public M invaspect = new M();
145
146     /** [UNIQUE] point in 3-space */
147     public final class P {
148
149         float x, y, z;
150
151         int watch_count;
152         float watch_x;
153         float watch_y;
154         float watch_z;
155         P watch;
156
157         private E e;                // some edge *leaving* this point
158         private M binding = new M();
159         private P bound_to = this;
160
161         private float oldscore = 0;
162         
163         private boolean inserted = false;
164
165         public P register() {
166             P p2 = ps.get(this);
167             if (p2==null) { p2 = this; ps.put(this,this); }
168             return p2;
169         }
170
171         public void kdremove() {
172             if (!inserted) return;
173             inserted = false;
174             P p = this;
175             try { kd.delete(new double[]{p.x,p.y,p.z}); } catch (Exception e) { }
176         }
177         public void kdinsert() {
178             if (inserted) return;
179             inserted = true;
180             P p = this;
181             try { kd.insert(new double[]{p.x,p.y,p.z},this); } catch (Exception e) { throw new Error(e); }
182         }
183
184         public float score() { return oldscore; }
185         public void unscore() {
186             if (watch == null) return;
187             watch.watch_x -= x;
188             watch.watch_y -= y;
189             watch.watch_z -= z;
190             watch.watch_count--;
191             if (watch.watch_count==0) {
192                 watch.watch_x = 0;
193                 watch.watch_y = 0;
194                 watch.watch_z = 0;
195             }
196             watch = null;
197         }
198         public P times(M m) { return m.times(this); }
199         public P partner() {
200             if (watch==null) return this;
201             return watch.times(score_against.aspect).times(invaspect);
202         }
203         public P watchback() {
204             if (watch_count==0) return partner();
205             return newP(watch_x/watch_count, watch_y/watch_count, watch_z/watch_count);
206         }
207         public void rescore() {
208             if (score_against == null) return;
209
210             score -= oldscore;
211             oldscore = 0;
212
213             if (watch != null) unscore();
214             P po = this.times(aspect).times(score_against.invaspect);
215             if (watch == null) {
216                 watch = score_against.nearest(po);
217
218                 // don't attract to vertices that face the other way
219                 if (watch.norm().times(score_against.aspect).times(invaspect).dot(norm()) < 0) {
220                     watch = null;
221                 } else {
222                     watch.watch_x += po.x;
223                     watch.watch_y += po.y;
224                     watch.watch_z += po.z;
225                     watch.watch_count++;
226                 }
227             }
228
229             double s1, s2;
230             if (watch_count==0) s1 = 0;
231             else                s1 = this.distance(watch_x/watch_count, watch_y/watch_count, watch_z/watch_count);
232             s2 = watch==null ? 0 : po.distance(watch);
233             oldscore = (float)(s1 + s2);
234             score += oldscore;
235         }
236
237         public float distance(P p) { return distance(p.x, p.y, p.z); }
238         public float distance(float ox, float oy, float oz) {
239             return 
240                 (float)Math.sqrt((x-ox)*(x-ox)+
241                                  (y-oy)*(y-oy)+
242                                  (z-oz)*(z-oz));
243         }
244
245         /** does NOT update bound pairs! */
246         public boolean transform(M m) {
247             // FIXME: screws up kdtree 
248             // FIXME: screws up hashmap
249             unscore();
250             try {
251                 if (ps.get(this)==null) throw new Error();
252                 ps.remove(this);
253                 float newx = m.a*x + m.b*y + m.c*z + m.d;
254                 float newy = m.e*x + m.f*y + m.g*z + m.h;
255                 float newz = m.i*x + m.j*y + m.k*z + m.l;
256                 this.x = newx;
257                 this.y = newy;
258                 this.z = newz;
259                 // FIXME: what if we move onto exactly where another point is?
260                 ps.put(this,this);
261             } catch (Exception e) {
262                 throw new RuntimeException(e);
263             }
264             rescore();
265             boolean good = true;
266             /*
267             for(T t : ts) {
268                 for(E e = this.e; ;) {
269                     if (e.intersects(t)) { good = false; break; }
270                     e = e.pair.next;
271                     if (e == this.e) break;
272                 }
273             }
274             */
275             /*
276                 if (t==this.t) continue;
277                 if (this.intersects(t)) good = false;
278             }
279             */
280             return good;
281         }
282         public boolean move(Vec v) {
283             M m = new M(v);
284             P p = this;
285             boolean good = true;
286             do {
287                 good &= p.transform(m);
288                 v = v.times(binding); // bleh wrong
289                 p = p.bound_to;
290             } while (p != this);
291             return good;
292         }
293
294         public E makeE(P p2) {
295             p2 = p2.register();
296             E e = getE(p2);
297             if (e != null) return e;
298             e = p2.getE(this);
299             if (this.e == null && p2.e == null) return this.e = new E(this, p2);
300             if (this.e == null && p2.e != null) return p2.makeE(this).pair;
301             return new E(getFreeIncident(), p2);
302         }
303
304         public E getFreeIncident() {
305             E ret = getFreeIncident(e, e);
306             if (ret != null) return ret;
307             ret = getFreeIncident(e.pair.next, e.pair.next);
308             if (ret == null) throw new Error("unable to find free incident to " + this);
309             return ret;
310         }
311
312         public E getFreeIncident(E start, E before) {
313             E e = start;
314             do {
315                 if (e.pair.p2 == this && e.pair.t == null && e.pair.next.t == null) return e.pair;
316                 e = e.pair.next;
317             } while(e != before);
318             return null;
319         }
320
321         public E getE(P p2) {
322             p2 = p2.register();
323             E e = this.e;
324             do {
325                 if (e==null) return null;
326                 if (e.p1 == this && e.p2 == p2) return e;
327                 e = e.pair.next;
328             } while (e!=this.e);
329             return null;
330         }
331
332         public boolean isBoundTo(P p) {
333             p = p.register();
334             P px = p;
335             do {
336                 if (px==this) return true;
337                 px = px.bound_to;
338             } while(px != p);
339             return false;
340         }
341
342         public void unbind() { bound_to = this; binding = new M(); }
343         public void bind(P p) { bind(p, new M()); }
344         public void bind(P p, M binding) {
345             p = p.register();
346             if (isBoundTo(p)) return;
347             P temp_bound_to = p.bound_to;
348             M temp_binding = p.binding;
349             p.bound_to = this.bound_to;
350             p.binding = binding.times(this.binding); // FIXME: may have order wrong here
351             this.bound_to = temp_bound_to;
352             this.binding = temp_binding.times(temp_binding); // FIXME: may have order wrong here
353         }
354
355         public P(float x, float y, float z) {
356             this.x = x; this.y = y; this.z = z;
357         }
358
359         public Vec minus(P p) { return new Vec(x-p.x, y-p.y, z-p.z); }
360         public P plus(Vec v) { return newP(x+v.x, y+v.y, z+v.z); }
361         public boolean equals(Object o) {
362             if (o==null || !(o instanceof P)) return false;
363             P p = (P)o;
364             return p.x==x && p.y==y && p.z==z;
365         }
366         // FIXME: moving a point alters its hashCode
367         public int hashCode() {
368             return
369                 Float.floatToIntBits(x) ^
370                 Float.floatToIntBits(y) ^
371                 Float.floatToIntBits(z);
372         }
373         public void glVertex(GL gl) {
374             this.times(aspect)._glVertex(gl);
375         }
376         private void _glVertex(GL gl) {
377             gl.glVertex3f(x, y, z);
378         }
379         public String toString() { return "("+x+","+y+","+z+")"; }
380         public Vec norm() {
381             Vec norm = new Vec(0, 0, 0);
382             E e = this.e;
383             do {
384                 if (e.t != null) norm = norm.plus(e.t.norm().times((float)e.prev.angle()));
385                 e = e.pair.next;
386             } while(e != this.e);
387             return norm.norm();
388         }
389     }
390
391     /** vector in 3-space */
392     public final class Vec {
393         public final float x, y, z;
394         public Vec(double x, double y, double z) { this((float)x, (float)y, (float)z); }
395         public Vec(float x, float y, float z) { this.x = x; this.y = y; this.z = z; }
396         public Vec(P p1, P p2) { this(p2.x-p1.x, p2.y-p1.y, p2.z-p1.z); }
397         public Vec cross(Vec v) { return new Vec(y*v.z-z*v.y, z*v.x-x*v.z, x*v.y-y*v.x); }
398         public Vec plus(Vec v) { return new Vec(x+v.x, y+v.y, z+v.z); }
399         public Vec norm() { return mag()==0 ? this : div(mag()); }
400         public Vec times(M m) { return m.apply(this); }
401         public float mag() { return (float)Math.sqrt(x*x+y*y+z*z); }
402         public float dot(Vec v) { return x*v.x + y*v.y + z*v.z; }
403         public Vec times(float mag) { return new Vec(x*mag, y*mag, z*mag); }
404         public Vec div(float mag) { return new Vec(x/mag, y/mag, z/mag); }
405         public String toString() { return "<"+x+","+y+","+z+">"; }
406     }
407
408     public class BindingGroup {
409         public HashSet<E> es = new HashSet<E>();
410         public BindingGroup() { }
411         public BindingGroup(E e) {
412             es.add(e);
413         }
414         public void add(E e) {
415             if (e.bg != null) { merge(e.bg); return; }
416             es.add(e);
417             e.bg = this;
418         }
419         public void merge(BindingGroup bg) {
420             for(E e : bg.es) {
421                 e.bg = null;
422                 add(e);
423             }
424         }
425     }
426
427     /** [UNIQUE] an edge */
428     public final class E implements Comparable<E> {
429
430         public boolean intersects(T t) {
431             double A0=t.p1().x, A1=t.p1().y, A2=t.p1().z;
432             double B0=t.p2().x, B1=t.p2().y, B2=t.p2().z;
433             double C0=t.p3().x, C1=t.p3().y, C2=t.p3().z;
434             double j0=p1.x, j1=p1.y, j2=p1.z;
435             double k0=p2.x, k1=p2.y, k2=p2.z;
436             double J0, J1, J2;
437             double K0, K1, K2;
438             double i0, i1, i2;
439             double a0, a1, a2;
440             double b0, b1, b2;
441             double c0, c1, c2;
442             double in_det;
443             double R00, R01, R02, R03,
444                 R10, R11, R12, R13,
445                 R20, R21, R22, R23,
446                 R30, R31, R32, R33;
447
448
449             /* a = B - A */
450             a0 = B0 - A0; 
451             a1 = B1 - A1; 
452             a2 = B2 - A2;
453             /* b = C - B */
454             b0 = C0 - A0;
455             b1 = C1 - A1;
456             b2 = C2 - A2;
457             /* c = a &times; b */
458             c0 = a1 * b2 - a2 * b1;
459             c1 = a2 * b0 - a0 * b2;
460             c2 = a0 * b1 - a1 * b0;
461  
462             /* M^(-1) = (1/det(M)) * adj(M) */
463             in_det = 1 / (c0 * c0 + c1 * c1 + c2 * c2);
464             R00 = (b1 * c2 - b2 * c1) * in_det;
465             R01 = (b2 * c0 - b0 * c2) * in_det;
466             R02 = (b0 * c1 - b1 * c0) * in_det;
467             R10 = (c1 * a2 - c2 * a1) * in_det;
468             R11 = (c2 * a0 - c0 * a2) * in_det;
469             R12 = (c0 * a1 - c1 * a0) * in_det;
470             R20 = (c0) * in_det;
471             R21 = (c1) * in_det;
472             R22 = (c2) * in_det;
473   
474             /* O = M^(-1) * A */
475             R03 = -(R00 * A0 + R01 * A1 + R02 * A2);
476             R13 = -(R10 * A0 + R11 * A1 + R12 * A2);
477             R23 = -(R20 * A0 + R21 * A1 + R22 * A2);
478  
479             /* fill in last row of 4x4 matrix */
480             R30 = R31 = R32 = 0;
481             R33 = 1;
482   
483             J2 = R20 * j0 + R21 * j1 + R22 * j2 + R23;
484             K2 = R20 * k0 + R21 * k1 + R22 * k2 + R23;
485             if (J2 * K2 >= 0) return false;
486
487             J0 = R00 * j0 + R01 * j1 + R02 * j2 + R03;
488             K0 = R00 * k0 + R01 * k1 + R02 * k2 + R03;
489             i0 = J0 + J2 * ((K0 - J0) / (J2 - K2));
490             if (i0 < 0 || i0 > 1) return false;
491   
492             J1 = R10 * j0 + R11 * j1 + R12 * j2 + R13;
493             K1 = R10 * k0 + R11 * k1 + R12 * k2 + R13;
494             i1 = J1 + J2 * ((K1 - J1) / (J2 - K2));
495             if (i1 < 0 || i1 > 1 || i0 + i1 > 1) return false;
496
497             return true;            
498         }
499
500         public int compareTo(E e) {
501             return e.length() > length() ? 1 : -1;
502         }
503
504         public final P p1, p2;
505         T t;     // triangle to our "left"
506         E prev;  // previous half-edge
507         E next;  // next half-edge
508         E pair;  // partner half-edge
509
510
511         public BindingGroup bg = new BindingGroup(this);
512
513         public void bind(E e) { bind(e, new M()); }
514         public void bind(E e, M m) { e.bg.add(this); }
515
516         public void dobind() {
517             if (bg==null) return;
518             for(E ex : bg.es) {
519                 if (ex==this) continue;
520                 p1.bind(ex.p1);
521                 p2.bind(ex.p2);
522             }
523         }
524
525         boolean shattered = false;
526         public P shatter() { return shatter(midpoint(), null, null); }
527         public P shatter(P mid, BindingGroup bg1, BindingGroup bg2) {
528             mid = mid.register();
529             if (shattered) return mid;
530             shattered = true;
531
532             P r = next.p2;
533             E next = this.next;
534             E prev = this.prev;
535
536             if (bg1==null) bg1 = new BindingGroup();
537             if (bg2==null) bg2 = new BindingGroup();
538             for(E e : bg.es) e.shatter(e.midpoint(), bg1, bg2);
539             pair.shatter();
540             destroy();
541
542             newT(r, p1, mid);
543             newT(r, mid, p2);
544             bg1.add(p1.getE(mid));
545             bg2.add(mid.getE(p2));
546             return mid;
547         }
548
549         public boolean destroyed = false;
550         public void destroy() {
551             if (destroyed) return;
552             destroyed = true;
553             pair.destroyed = true;
554             if (next.t != null) next.t.destroy();
555             if (prev.t != null) prev.t.destroy();
556             if (pair.next.t != null) ts.remove(pair.next.t);
557             if (pair.prev.t != null) ts.remove(pair.prev.t);
558             next.t = null;
559             prev.t = null;
560             pair.next.t = null;
561             pair.prev.t = null;
562             this.bg = null;
563             pair.bg = null;
564             pair.prev.next = next;
565             next.prev = pair.prev;
566             prev.next = pair.next;
567             pair.next = prev;
568             if (p1.e == this) p1.e = prev.next;
569             if (pair.p1.e == pair) pair.p1.e = pair.prev.next;
570             es.remove(this);
571             es.remove(pair);
572             avgedge -= this.length();
573             avgedge -= pair.length();
574             numedges--;
575             numedges--;
576         }
577
578         private void sync() {
579             this.prev.next = this;
580             this.next.prev = this;
581             this.pair.pair = this;
582             if (this.next.p1 != p2) throw new Error();
583             if (this.prev.p2 != p1) throw new Error();
584             if (this.p1.e == null) this.p1.e = this;
585             es.add(this);
586             if (!added) {
587                 added = true;
588                 numedges++;
589                 avgedge += length();
590             }
591         }
592         private boolean added = false;
593
594         public T makeT() { return t==null ? (t = new T(this)) : t; }
595
596         /** angle between this half-edge and the next */
597         public double angle() {
598             Vec v1 = next.p2.minus(p2);
599             Vec v2 = this.p1.minus(p2);
600             return Math.acos(v1.norm().dot(v2.norm()));
601         }
602
603         public void makeAdjacent(E e) {
604             if (this.next == e) return;
605             if (p2 != e.p1) throw new Error("cannot make adjacent -- no shared vertex");
606             if (t != null || e.t != null) throw new Error("cannot make adjacent -- edges not both free");
607
608             E freeIncident = p2.getFreeIncident(e, this);
609
610             e.prev.next = freeIncident.next;
611             freeIncident.next.prev = e.prev;
612
613             freeIncident.next = this.next;
614             this.next.prev = freeIncident;
615             
616             this.next = e;
617             e.prev = this;
618
619             sync();
620             freeIncident.sync();
621         }
622
623         /** creates an isolated edge out in the middle of space */
624         public E(P p1, P p2) {
625             p1 = p1.register();
626             p2 = p2.register();
627             if (p1==p2) throw new Error("attempt to create edge with single vertex: " + p1);
628             this.p1 = p1;
629             this.p2 = p2;
630             this.prev = this.next = this.pair = new E(this, this, this);
631             sync();
632         }
633
634         /** adds a new half-edge from prev.p2 to p2 */
635         public E(E prev, P p2) {
636             p2 = p2.register();
637             this.p1 = prev.p2;
638             this.p2 = p2;
639             this.prev = prev;
640             if (p2.getE(p1) != null) throw new Error();
641             if (p2.e==null) {
642                 this.next = this.pair = new E(this, this, prev.next);
643             } else {
644                 E q = p2.getFreeIncident();
645                 this.next = q.next;
646                 this.next.prev = this;
647                 E z = prev.next;
648                 this.prev.next = this;
649                 this.pair = new E(q, this, z);
650             }
651             sync();
652         }
653
654         /** adds a new half-edge to the mesh with a given predecessor, successor, and pair */
655         public E(E prev, E pair, E next) {
656             this.p1 = prev.p2;
657             this.p2 = next.p1;
658             this.prev = prev;
659             this.next = next;
660             this.pair = pair;
661             sync();
662         }
663         public P midpoint() { return newP((p1.x+p2.x)/2, (p1.y+p2.y)/2, (p1.z+p2.z)/2).register(); }
664         public boolean has(P p) {
665             p = p.register();
666             return p==p1 || p==p2;
667         }
668         public float length() { return p1.minus(p2).mag(); }
669         public String toString() { return p1+"->"+p2; }
670     }
671
672     /** [UNIQUE] a triangle (face) */
673     public final class T {
674         public final E e1;
675         public final int color;
676
677         public void destroy() {
678             ts.remove(this);
679         }
680
681         public P nearest(P p) {
682             float d1 = p1().distance(p);
683             float d2 = p2().distance(p);
684             float d3 = p3().distance(p);
685             if (d1 < d2 && d1 < d3) return p1();
686             if (d2 < d3) return p2();
687             return p3();
688         }
689
690         T(E e1) {
691             this.e1 = e1;
692             E e2 = e1.next;
693             E e3 = e2.next;
694             if (e1==e2     || e1==e3) throw new Error();
695             if (e3.next!=e1) throw new Error();
696             if (e1.t!=null || e2.t!=null || e3.t!=null)
697                 throw new Error("non-manifold surface or disagreeing normals");
698             e1.t = this;
699             e1.next.t = this;
700             e1.next.next.t = this;
701
702             // FIXME: check for sealed/watertight surface once construction is complete (and infer normal(s)?)
703
704             int color = Math.abs(random.nextInt());
705             while(true) {
706                 color = color % 4;
707                 if (e1().pair.t != null && color == e1().pair.t.color) { color++; continue; }
708                 if (e2().pair.t != null && color == e2().pair.t.color) { color++; continue; }
709                 if (e3().pair.t != null && color == e3().pair.t.color) { color++; continue; }
710                 break;
711             }
712
713             // FIXME unnecssary
714             ts.add(this);
715             p1().kdinsert();
716             p2().kdinsert();
717             p3().kdinsert();
718
719             this.color = color;
720         }
721         public P p1() { return e1.p1; }
722         public P p2() { return e1.p2; }
723         public P p3() { return e1.next.p2; }
724         public E e1() { return e1; }
725         public E e2() { return e1.next; }
726         public E e3() { return e1.prev; }
727         public Vec norm() { return p2().minus(p1()).cross(p3().minus(p1())).norm(); }
728         public boolean hasE(E e) { return e1==e || e1.next==e || e1.prev==e; }
729         public boolean has(P p) { return p1()==p || p2()==p || p3()==p; }
730
731         public float area() {
732             return (float)Math.abs(0.5 * e1().length() * new Vec(p1(), p2()).norm().dot(new Vec(p2(), p3())));
733         }
734
735         public void glVertices(GL gl) {
736             p1().glVertex(gl);
737             p2().glVertex(gl);
738             p3().glVertex(gl);
739         }
740
741         public P centroid() { return newP((p1().x+p2().x+p3().x)/3,
742                                           (p1().y+p2().y+p3().y)/3, 
743                                           (p1().z+p2().z+p3().z)/3); }
744         public float diameter() {
745             // FIXME: what is this supposed to be?
746             return Math.max(Math.max(e1().length(), e2().length()), e3().length()) / 2;
747         }
748
749
750     }
751
752
753     /** matrix */
754     public class M {
755         //
756         //  [ a b c d ]   [ x ]
757         //  [ e f g h ]   [ y ]
758         //  [ i j k l ]   [ z ]
759         //  [ 0 0 0 1 ]   [ 1 ]
760         //
761         public final float a, b, c, d, e, f, g, h, i, j, k, l;
762         public M() { this(1); }
763         public M(float scale) {
764             a = f = k = scale;
765             l = h = d = e = b = i = c = j = g = 0;            
766         }
767         public M(float scalex, float scaley, float scalez) {
768             a = scalex;
769             f = scaley;
770             k = scalez;
771             l = h = d = e = b = i = c = j = g = 0;            
772         }
773         public M(Vec translate) {
774             d = translate.x; h = translate.y; l = translate.z;
775             a = f = k = 1;
776             b = c = e = g = i = j = 0;
777         }
778         public M(float a, float b, float c, float d, float e, float f, float g, float h, float i, float j, float k, float l) {
779             this.a = a; this.b = b; this.c = c; this.d = d; this.e = e; this.f = f; this.g = g; this.h = h; this.i = i;
780             this.j = j; this.k = k; this.l = l;
781         }
782         public M times(float x) {
783             return new M(a*x, b*x, c*x, d*x, e*x, f*x, g*x, h*x, i*x, j*x, k*x, l*x);
784         }
785         public M(Vec axis, float angle) {
786             double q = Math.cos(angle);
787             double s = Math.sin(angle);
788             double t = 1.0 - q;
789             a = (float)(q + axis.x*axis.x*t);
790             f = (float)(q + axis.y*axis.y*t);
791             k = (float)(q + axis.z*axis.z*t);
792             double tmp1 = axis.x*axis.y*t;
793             double tmp2 = axis.z*s;
794             e = (float)(tmp1 + tmp2);
795             b = (float)(tmp1 - tmp2);
796             tmp1 = axis.x*axis.z*t;
797             tmp2 = axis.y*s;
798             i = (float)(tmp1 - tmp2);
799             c = (float)(tmp1 + tmp2);
800             tmp1 = axis.y*axis.z*t;
801             tmp2 = axis.x*s;
802             j = (float)(tmp1 + tmp2);
803             g = (float)(tmp1 - tmp2);
804             d = h = l = 0;
805         }
806         public P times(P p) {
807             return newP(a*p.x + b*p.y + c*p.z + d,
808                         e*p.x + f*p.y + g*p.z + h,
809                         i*p.x + j*p.y + k*p.z + l);
810         }
811         public P apply(P p) { return p; }
812         public Vec apply(Vec v) { return v; }
813         public M invert() { return this; }
814         public M times(M m) { return this; }
815     }
816
817     public void unbind() {
818
819         for(Geom.T t : this) {
820             t.p1().unbind();
821             t.p2().unbind();
822             t.p3().unbind();
823         }
824
825     }
826     public void bind() {
827         for(Geom.T t : this) {
828             t.e1().dobind();
829             t.e2().dobind();
830             t.e3().dobind();
831         }
832     }
833     public int numedges = 0;
834     public float avgedge = 0;
835 }