checkpoint
[anneal.git] / src / edu / berkeley / qfat / Mesh.java
1 package edu.berkeley.qfat;
2 import java.awt.*;
3 import java.util.*;
4 import java.awt.event.*;
5 import javax.swing.*;
6 import javax.media.opengl.*;
7 import javax.media.opengl.glu.*;
8 import edu.berkeley.qfat.geom.*;
9 import edu.wlu.cs.levy.CG.KDTree;
10 import edu.berkeley.qfat.geom.Point;
11
12 public class Mesh implements Iterable<Mesh.T> {
13
14     public static final float EPSILON = (float)0.0001;
15     public static final Random random = new Random();
16
17     private PointSet<Vert> pointset = new PointSet<Vert>();
18
19     public Iterable<Vert> vertices() { return pointset; }
20
21     public Iterable<E> edges() {
22         return
23             new Iterable<E>() {
24             public Iterator<E> iterator() {
25                 // HACK
26                 HashSet<E> hse = new HashSet<E>();
27                 for(T t : Mesh.this) {
28                     hse.add(t.e1());
29                     hse.add(t.e2());
30                     hse.add(t.e3());
31                     hse.add(t.e1().pair);
32                     hse.add(t.e2().pair);
33                     hse.add(t.e3().pair);
34                 }
35                 return hse.iterator();
36             } };
37     }
38
39     public Iterator<T> iterator() {
40         for(Vert v : pointset)
41             if (v.e != null && v.e.t != null)
42                 return new FaceIterator(v);
43         return new FaceIterator();
44     }
45
46     public Mesh score_against = null;
47     public double score = 0;
48     public float score() { return (float)score; }
49
50     public int numedges = 0;
51     public float avgedge = 0;
52
53     public void rebindPoints() {
54         // unbind all points
55         for(Mesh.T t : this) {
56             t.v1().unbind();
57             t.v2().unbind();
58             t.v3().unbind();
59         }
60         // ask edges to re-implement their bindings
61         for(Mesh.T t : this) {
62             t.e1().dobind();
63             t.e2().dobind();
64             t.e3().dobind();
65         }
66     }
67
68     public void unApplyQuadricToNeighborAll() {
69         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
70         for(T t : this)
71             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
72                 if (done.contains(p)) continue;
73                 done.add(p);
74                 p.unApplyQuadricToNeighbor();
75             }
76     }
77     public void recomputeAllFundamentalQuadrics() {
78         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
79         for(T t : this)
80             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
81                 if (done.contains(p)) continue;
82                 done.add(p);
83                 p.recomputeFundamentalQuadric();
84             }
85     }
86     public float applyQuadricToNeighborAll() {
87         int num = 0;
88         double dist = 0;
89         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
90         for(T t : this)
91             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
92                 if (done.contains(p)) continue;
93                 done.add(p);
94                 p.applyQuadricToNeighbor();
95                 
96             }
97         return (float)(dist/num);
98     }
99
100     public void transform(Matrix m) {
101         ArrayList<Vert> set = new ArrayList<Vert>();
102         for (Vert v : pointset)
103             set.add(v);
104         for(Vert v : set) v.transform(m);
105     }
106
107     public float volume() {
108         double total = 0;
109         for(T t : this) {
110             double area = t.area();
111             Vec origin_to_centroid = new Vec(new Point(0, 0, 0), t.centroid());
112             boolean facingAway = t.norm().dot(origin_to_centroid) > 0;
113             double height = Math.abs(t.norm().dot(origin_to_centroid));
114             total += ((facingAway ? 1 : -1) * area * height) / 3.0;
115         }
116         return (float)total;
117     }
118
119     public class BindingGroup {
120         public HashSet<E> es = new HashSet<E>();
121         public BindingGroup() { }
122         public BindingGroup(E e) {
123             es.add(e);
124         }
125         public void add(E e) {
126             if (e.bg != null) { merge(e.bg); return; }
127             es.add(e);
128             e.bg = this;
129         }
130         public void merge(BindingGroup bg) {
131             for(E e : bg.es) {
132                 e.bg = null;
133                 add(e);
134             }
135         }
136     }
137
138     public void rebuildPointSet() { pointset.rebuild(); }
139     public Vec diagonal() { return pointset.diagonal(); }
140     public Point centroid() { return pointset.centroid(); }
141     public Vert nearest(Point p) { return pointset.nearest(p); }
142
143     public final class Vert extends HasPoint {
144         public Point p;
145         E e;                // some edge *leaving* this point
146
147         /** the nearest vertex in the "score_against" mesh */
148         Vert   nearest_in_other_mesh;
149         /** the number of vertices in the other mesh for which this is the nearest_in_other_mesh */
150         int    quadric_count;
151         /** the total error quadric (contributions from all vertices in other mesh for which this is nearest) */
152         Matrix quadric = Matrix.ZERO;
153
154         Vert bound_to = this;
155         Matrix binding = new Matrix();
156         float oldscore = 0;
157         boolean quadricStale = false;
158
159         public Matrix errorQuadric() { return quadric; }
160         public Point getPoint() { return p; }
161         public float score() { return oldscore; }
162
163         private Matrix fundamentalQuadric = null;
164         public Matrix fundamentalQuadric() {
165             if (fundamentalQuadric == null) recomputeFundamentalQuadric();
166             return fundamentalQuadric;
167         }
168
169         private Vert(Point p) {
170             this.p = p;
171             if (pointset.get(p) != null) throw new Error();
172             pointset.add(this);
173         }
174
175         public void recomputeFundamentalQuadric() {
176             if (!quadricStale && fundamentalQuadric != null) return;
177             quadricStale = false;
178             unApplyQuadricToNeighbor();
179             Matrix m = Matrix.ZERO;
180             E e = this.e;
181             do {
182                 T t = e.t;
183                 m = m.plus(t.norm().fundamentalQuadric(t.centroid()));
184                 e = e.pair.next;
185             } while(e != this.e);
186             fundamentalQuadric = m;
187             applyQuadricToNeighbor();
188         }
189
190         public void unApplyQuadricToNeighbor() {
191             if (nearest_in_other_mesh == null) return;
192             if (fundamentalQuadric == null) return;
193             nearest_in_other_mesh.unComputeError();
194             nearest_in_other_mesh.quadric = nearest_in_other_mesh.quadric.minus(fundamentalQuadric);
195             nearest_in_other_mesh.quadric_count--;
196             if (nearest_in_other_mesh.quadric_count==0)
197                 nearest_in_other_mesh.quadric = Matrix.ZERO;
198             nearest_in_other_mesh.computeError();
199             nearest_in_other_mesh = null;
200         }
201
202         public void applyQuadricToNeighbor() {
203             if (score_against == null) return;
204
205             Vert new_nearest = score_against.nearest(p);
206             if (nearest_in_other_mesh != null && new_nearest == nearest_in_other_mesh) return;
207
208             if (nearest_in_other_mesh != null) unApplyQuadricToNeighbor();
209             if (nearest_in_other_mesh != null) throw new Error();
210
211             nearest_in_other_mesh = new_nearest;
212                 
213             // don't attract to vertices that face the other way
214             if (nearest_in_other_mesh.e == null || nearest_in_other_mesh.norm().dot(norm()) < 0) {
215                 nearest_in_other_mesh = null;
216             } else {
217                 nearest_in_other_mesh.unComputeError();
218                 nearest_in_other_mesh.quadric = nearest_in_other_mesh.quadric.plus(fundamentalQuadric());
219                 nearest_in_other_mesh.quadric_count++;
220                 nearest_in_other_mesh.computeError();
221             }
222             reComputeError();
223         }
224
225         public void reComputeError() {
226             unComputeError();
227             computeError();
228         }
229         public void unComputeError() {
230             score -= oldscore;
231             oldscore = 0;
232         }
233         public void computeError() {
234             oldscore = quadric_count == 0 ? 0 : (quadric.preAndPostMultiply(p) / quadric_count);
235             score += oldscore;
236         }
237
238         /** does NOT update bound pairs! */
239         public boolean transform(Matrix m) {
240             unApplyQuadricToNeighbor();
241             try {
242                 if (pointset.get(this.p)==null) throw new Error();
243                 pointset.remove(this);
244                 float newx = m.a*p.x + m.b*p.y + m.c*p.z + m.d;
245                 float newy = m.e*p.x + m.f*p.y + m.g*p.z + m.h;
246                 float newz = m.i*p.x + m.j*p.y + m.k*p.z + m.l;
247                 this.p = new Point(newx, newy, newz);
248                 pointset.add(this);
249             } catch (Exception e) {
250                 throw new RuntimeException(e);
251             }
252             applyQuadricToNeighbor();
253
254             // should recompute fundamental quadrics of all vertices sharing a face, but we defer...
255             E e = this.e;
256             do {
257                 e.p2.quadricStale = true;
258                 e = e.pair.next;
259             } while(e != this.e);
260
261
262             // FIXME: intersection test needed?
263             return true;
264         }
265
266         public boolean move(Vec v) {
267             Matrix m = new Matrix(v);
268             Vert p = this;
269             boolean good = true;
270             do {
271                 good &= p.transform(m);
272                 p = p.bound_to;
273             } while (p != this);
274             return good;
275         }
276
277         public E getFreeIncident() {
278             E ret = getFreeIncident(e, e);
279             if (ret != null) return ret;
280             ret = getFreeIncident(e.pair.next, e.pair.next);
281             if (ret == null) throw new Error("unable to find free incident to " + this);
282             return ret;
283         }
284
285         public E getFreeIncident(E start, E before) {
286             E e = start;
287             do {
288                 if (e.pair.p2 == this && e.pair.t == null && e.pair.next.t == null) return e.pair;
289                 e = e.pair.next;
290             } while(e != before);
291             return null;
292         }
293
294         public E getE(Point p2) {
295             Vert v = pointset.get(p2);
296             if (v==null) return null;
297             return getE(v);
298         }
299         public E getE(Vert p2) {
300             E e = this.e;
301             do {
302                 if (e==null) return null;
303                 if (e.p1 == this && e.p2 == p2) return e;
304                 e = e.pair.next;
305             } while (e!=this.e);
306             return null;
307         }
308
309         public Vec norm() {
310             Vec norm = new Vec(0, 0, 0);
311             E e = this.e;
312             do {
313                 if (e.t != null) norm = norm.plus(e.t.norm().times((float)e.prev.angle()));
314                 e = e.pair.next;
315             } while(e != this.e);
316             return norm.norm();
317         }
318
319         public boolean isBoundTo(Vert p) {
320             Vert px = p;
321             do {
322                 if (px==this) return true;
323                 px = px.bound_to;
324             } while(px != p);
325             return false;
326         }
327         public void unbind() { bound_to = this; binding = new Matrix(); }
328         public void bind(Vert p) { bind(p, new Matrix()); }
329         public void bind(Vert p, Matrix binding) {
330             if (isBoundTo(p)) return;
331             Vert temp_bound_to = p.bound_to;
332             Matrix temp_binding = p.binding;
333             p.bound_to = this.bound_to;
334             p.binding = binding.times(this.binding); // FIXME: may have order wrong here
335             this.bound_to = temp_bound_to;
336             this.binding = temp_binding.times(temp_binding); // FIXME: may have order wrong here
337         }
338     }
339
340     /** [UNIQUE] an edge */
341     public final class E implements Comparable<E> {
342
343         public final Vert p1, p2;
344         T t;     // triangle to our "left"
345         E prev;  // previous half-edge
346         E next;  // next half-edge
347         E pair;  // partner half-edge
348         public BindingGroup bg = new BindingGroup(this);
349         boolean shattered = false;
350
351         public int compareTo(E e) { return e.length() > length() ? 1 : -1; }
352
353         public void bind(E e) { bind(e, new Matrix()); }
354         public void bind(E e, Matrix m) { e.bg.add(this); }
355
356         public void dobind() {
357             if (bg==null) return;
358             for(E ex : bg.es) {
359                 if (ex==this) continue;
360                 p1.bind(ex.p1);
361                 p2.bind(ex.p2);
362             }
363         }
364
365         public Point shatter() { return shatter(midpoint(), null, null); }
366         public Point shatter(Point mid, BindingGroup bg1, BindingGroup bg2) {
367             if (shattered) return mid;
368             shattered = true;
369
370             Vert r = next.p2;
371             E next = this.next;
372             E prev = this.prev;
373
374             if (bg1==null) bg1 = new BindingGroup();
375             if (bg2==null) bg2 = new BindingGroup();
376             for(E e : bg.es) e.shatter(e.midpoint(), bg1, bg2);
377             pair.shatter();
378             destroy();
379
380             newT(r.p, p1.p, mid, null);
381             newT(r.p, mid, p2.p, null);
382             bg1.add(p1.getE(mid));
383             bg2.add(p2.getE(mid).pair);
384             return mid;
385         }
386
387         public boolean destroyed = false;
388         public void destroy() {
389             if (destroyed) return;
390             destroyed = true;
391             pair.destroyed = true;
392             if (next.t != null) next.t.destroy();
393             if (prev.t != null) prev.t.destroy();
394             next.t = null;
395             prev.t = null;
396             pair.next.t = null;
397             pair.prev.t = null;
398             this.bg = null;
399             pair.bg = null;
400             pair.prev.next = next;
401             next.prev = pair.prev;
402             prev.next = pair.next;
403             pair.next = prev;
404             if (p1.e == this) p1.e = prev.next;
405             if (pair.p1.e == pair) pair.p1.e = pair.prev.next;
406             avgedge -= this.length();
407             avgedge -= pair.length();
408             numedges--;
409             numedges--;
410         }
411
412         private void sync() {
413             this.prev.next = this;
414             this.next.prev = this;
415             this.pair.pair = this;
416             if (this.next.p1 != p2) throw new Error();
417             if (this.prev.p2 != p1) throw new Error();
418             if (this.p1.e == null) this.p1.e = this;
419             if (!added) {
420                 added = true;
421                 numedges++;
422                 avgedge += length();
423             }
424         }
425         private boolean added = false;
426
427         public T makeT() { return t==null ? (t = new T(this)) : t; }
428
429         /** angle between this half-edge and the next */
430         public double angle() {
431             Vec v1 = next.p2.p.minus(p2.p);
432             Vec v2 = this.p1.p.minus(p2.p);
433             return Math.acos(v1.norm().dot(v2.norm()));
434         }
435
436         public void makeAdjacent(E e) {
437             if (this.next == e) return;
438             if (p2 != e.p1) throw new Error("cannot make adjacent -- no shared vertex");
439             if (t != null || e.t != null) throw new Error("cannot make adjacent -- edges not both free");
440
441             E freeIncident = p2.getFreeIncident(e, this);
442
443             e.prev.next = freeIncident.next;
444             freeIncident.next.prev = e.prev;
445
446             freeIncident.next = this.next;
447             this.next.prev = freeIncident;
448             
449             this.next = e;
450             e.prev = this;
451
452             sync();
453             freeIncident.sync();
454         }
455
456         /** creates an isolated edge out in the middle of space */
457         public E(Point p1, Point p2) {
458             if (pointset.get(p1) != null) throw new Error();
459             if (pointset.get(p2) != null) throw new Error();
460             this.p1 = new Vert(p1);
461             this.p2 = new Vert(p2);
462             this.prev = this.next = this.pair = new E(this, this, this);
463             this.p1.e = this;
464             this.p2.e = this.pair;
465             sync();
466         }
467
468         /** adds a new half-edge from prev.p2 to p2 */
469         public E(E prev, Point p) {
470             Vert p2;
471             p2 = pointset.get(p);
472             if (p2 == null) p2 = new Vert(p);
473             this.p1 = prev.p2;
474             this.p2 = p2;
475             this.prev = prev;
476             if (p2.getE(p1) != null) throw new Error();
477             if (p2.e==null) {
478                 this.next = this.pair = new E(this, this, prev.next);
479             } else {
480                 E q = p2.getFreeIncident();
481                 this.next = q.next;
482                 this.next.prev = this;
483                 E z = prev.next;
484                 this.prev.next = this;
485                 this.pair = new E(q, this, z);
486             }
487             if (p2.e==null) p2.e = this.pair;
488             sync();
489         }
490
491         /** adds a new half-edge to the mesh with a given predecessor, successor, and pair */
492         public E(E prev, E pair, E next) {
493             this.p1 = prev.p2;
494             this.p2 = next.p1;
495             this.prev = prev;
496             this.next = next;
497             this.pair = pair;
498             sync();
499         }
500         public Point midpoint() { return new Point((p1.p.x+p2.p.x)/2, (p1.p.y+p2.p.y)/2, (p1.p.z+p2.p.z)/2); }
501         public boolean has(Vert v) { return v==p1 || v==p2; }
502         public float length() { return p1.p.minus(p2.p).mag(); }
503         public String toString() { return p1+"->"+p2; }
504
505         public boolean intersects(T t) {
506             double A0=t.v1().p.x, A1=t.v1().p.y, A2=t.v1().p.z;
507             double B0=t.v2().p.x, B1=t.v2().p.y, B2=t.v2().p.z;
508             double C0=t.v3().p.x, C1=t.v3().p.y, C2=t.v3().p.z;
509             double j0=p1.p.x, j1=p1.p.y, j2=p1.p.z;
510             double k0=p2.p.x, k1=p2.p.y, k2=p2.p.z;
511             double J0, J1, J2;
512             double K0, K1, K2;
513             double i0, i1, i2;
514             double a0, a1, a2;
515             double b0, b1, b2;
516             double c0, c1, c2;
517             double in_det;
518             double R00, R01, R02, R03,
519                 R10, R11, R12, R13,
520                 R20, R21, R22, R23,
521                 R30, R31, R32, R33;
522
523
524             /* a = B - A */
525             a0 = B0 - A0; 
526             a1 = B1 - A1; 
527             a2 = B2 - A2;
528             /* b = C - B */
529             b0 = C0 - A0;
530             b1 = C1 - A1;
531             b2 = C2 - A2;
532             /* c = a &times; b */
533             c0 = a1 * b2 - a2 * b1;
534             c1 = a2 * b0 - a0 * b2;
535             c2 = a0 * b1 - a1 * b0;
536  
537             /* M^(-1) = (1/det(M)) * adj(M) */
538             in_det = 1 / (c0 * c0 + c1 * c1 + c2 * c2);
539             R00 = (b1 * c2 - b2 * c1) * in_det;
540             R01 = (b2 * c0 - b0 * c2) * in_det;
541             R02 = (b0 * c1 - b1 * c0) * in_det;
542             R10 = (c1 * a2 - c2 * a1) * in_det;
543             R11 = (c2 * a0 - c0 * a2) * in_det;
544             R12 = (c0 * a1 - c1 * a0) * in_det;
545             R20 = (c0) * in_det;
546             R21 = (c1) * in_det;
547             R22 = (c2) * in_det;
548   
549             /* O = M^(-1) * A */
550             R03 = -(R00 * A0 + R01 * A1 + R02 * A2);
551             R13 = -(R10 * A0 + R11 * A1 + R12 * A2);
552             R23 = -(R20 * A0 + R21 * A1 + R22 * A2);
553  
554             /* fill in last row of 4x4 matrix */
555             R30 = R31 = R32 = 0;
556             R33 = 1;
557   
558             J2 = R20 * j0 + R21 * j1 + R22 * j2 + R23;
559             K2 = R20 * k0 + R21 * k1 + R22 * k2 + R23;
560             if (J2 * K2 >= 0) return false;
561
562             J0 = R00 * j0 + R01 * j1 + R02 * j2 + R03;
563             K0 = R00 * k0 + R01 * k1 + R02 * k2 + R03;
564             i0 = J0 + J2 * ((K0 - J0) / (J2 - K2));
565             if (i0 < 0 || i0 > 1) return false;
566   
567             J1 = R10 * j0 + R11 * j1 + R12 * j2 + R13;
568             K1 = R10 * k0 + R11 * k1 + R12 * k2 + R13;
569             i1 = J1 + J2 * ((K1 - J1) / (J2 - K2));
570             if (i1 < 0 || i1 > 1 || i0 + i1 > 1) return false;
571
572             return true;            
573         }
574     }
575
576     public E makeE(Point p1, Point p2) {
577         Vert v1 = pointset.get(p1);
578         Vert v2 = pointset.get(p2);
579         if (v1 != null && v2 != null) {
580             E e = v1.getE(v2);
581             if (e != null) return e;
582             e = v2.getE(v1);
583             if (e != null) return e;
584         }
585         if (v1 != null) return new E(v1.getFreeIncident(), p2);
586         if (v2 != null) return new E(v2.getFreeIncident(), p1).pair;
587         return new E(p1, p2);
588     }
589     public T newT(Point p1, Point p2, Point p3, Vec norm) {
590         if (norm != null) {
591             Vec norm2 = p3.minus(p1).cross(p2.minus(p1));
592             float dot = norm.dot(norm2);
593             //if (Math.abs(dot) < EPointSILON) throw new Error("dot products within evertsilon of each other: "+norm+" "+norm2);
594             if (dot < 0) { Point p = p1; p1=p2; p2 = p; }
595         }
596         E e12 = makeE(p1, p2);
597         E e23 = makeE(p2, p3);
598         E e31 = makeE(p3, p1);
599         while(e12.next != e23 || e23.next != e31 || e31.next != e12) {
600             e12.makeAdjacent(e23);
601             e23.makeAdjacent(e31);
602             e31.makeAdjacent(e12);
603         }
604         T ret = e12.makeT();
605         if (e12.t == null) throw new Error();
606         if (e23.t == null) throw new Error();
607         if (e31.t == null) throw new Error();
608         return ret;
609     }
610
611
612     public class FaceIterator implements Iterator<T> {
613         private HashSet<T> visited = new HashSet<T>();
614         private LinkedList<T> next = new LinkedList<T>();
615         public FaceIterator() { }
616         public FaceIterator(Vert v) { next.addFirst(v.e.t); }
617         public boolean hasNext() { return next.peek()!=null; }
618         public void remove() { throw new Error(); }
619         public T next() {
620             T ret = next.removeFirst();
621             if (ret == null) return null;
622             visited.add(ret);
623             T t1 = ret.e1().pair.t;
624             T t2 = ret.e2().pair.t;
625             T t3 = ret.e3().pair.t;
626             if (t1 != null && !visited.contains(t1)) next.addFirst(t1);
627             if (t2 != null && !visited.contains(t2)) next.addFirst(t2);
628             if (t3 != null && !visited.contains(t3)) next.addFirst(t3);
629             return ret;
630         }
631     }
632
633     /** [UNIQUE] a triangle (face) */
634     public final class T extends Triangle {
635         public final E e1;
636         public final int color;
637
638         public void destroy() {
639         }
640
641         T(E e1) {
642             this.e1 = e1;
643             E e2 = e1.next;
644             E e3 = e2.next;
645             if (e1==e2 || e1==e3) throw new Error();
646             if (e3.next!=e1) throw new Error();
647             if (e1.t!=null || e2.t!=null || e3.t!=null) throw new Error("non-manifold surface or disagreeing normals");
648             e1.t = this;
649             e1.next.t = this;
650             e1.next.next.t = this;
651
652             // FIXME: check for sealed/watertight surface once construction is complete (and infer normal(s)?)
653
654             int color = Math.abs(random.nextInt());
655             while(true) {
656                 color = color % 4;
657                 if (e1().pair.t != null && color == e1().pair.t.color) { color++; continue; }
658                 if (e2().pair.t != null && color == e2().pair.t.color) { color++; continue; }
659                 if (e3().pair.t != null && color == e3().pair.t.color) { color++; continue; }
660                 break;
661             }
662             this.color = color;
663         }
664         public E e1() { return e1; }
665         public E e2() { return e1.next; }
666         public E e3() { return e1.prev; }
667         public Vert v1() { return e1.p1; }
668         public Vert v2() { return e1.p2; }
669         public Vert v3() { return e1.next.p2; }
670         public Point p1() { return e1.p1.p; }
671         public Point p2() { return e1.p2.p; }
672         public Point p3() { return e1.next.p2.p; }
673         public boolean hasE(E e) { return e1==e || e1.next==e || e1.prev==e; }
674         public boolean has(Vert v) { return v1()==v || v2()==v || v3()==v; }
675     }
676
677 }