checkpoint
[anneal.git] / src / edu / berkeley / qfat / Mesh.java
1 package edu.berkeley.qfat;
2 import java.awt.*;
3 import java.util.*;
4 import java.awt.event.*;
5 import javax.swing.*;
6 import javax.media.opengl.*;
7 import javax.media.opengl.glu.*;
8 import edu.berkeley.qfat.geom.*;
9 import edu.wlu.cs.levy.CG.KDTree;
10 import edu.berkeley.qfat.geom.Point;
11
12 public class Mesh implements Iterable<Mesh.T> {
13
14     public static final float EPSILON = (float)0.0001;
15     public static final Random random = new Random();
16
17     private PointSet<Vert> pointset = new PointSet<Vert>();
18
19     public Iterable<Vert> vertices() { return pointset; }
20
21     public Iterable<E> edges() {
22         return
23             new Iterable<E>() {
24             public Iterator<E> iterator() {
25                 // HACK
26                 HashSet<E> hse = new HashSet<E>();
27                 for(T t : Mesh.this) {
28                     hse.add(t.e1());
29                     hse.add(t.e2());
30                     hse.add(t.e3());
31                     hse.add(t.e1().pair);
32                     hse.add(t.e2().pair);
33                     hse.add(t.e3().pair);
34                 }
35                 return hse.iterator();
36             } };
37     }
38
39     public Iterator<T> iterator() {
40         for(Vert v : pointset)
41             if (v.e != null && v.e.t != null)
42                 return new FaceIterator(v);
43         return new FaceIterator();
44     }
45
46     public Mesh score_against = null;
47     public double score = 0;
48     public float score() { return (float)score; }
49
50     public int numedges = 0;
51     public float avgedge = 0;
52
53     public void rebindPoints() {
54         // unbind all points
55         for(Mesh.T t : this) {
56             t.v1().unbind();
57             t.v2().unbind();
58             t.v3().unbind();
59         }
60         // ask edges to re-implement their bindings
61         for(Mesh.T t : this) {
62             t.e1().dobind();
63             t.e2().dobind();
64             t.e3().dobind();
65         }
66     }
67
68     public void unApplyQuadricToNeighborAll() {
69         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
70         for(T t : this)
71             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
72                 if (done.contains(p)) continue;
73                 done.add(p);
74                 p.unApplyQuadricToNeighbor();
75             }
76     }
77     public void recomputeAllFundamentalQuadrics() {
78         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
79         for(T t : this)
80             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
81                 if (done.contains(p)) continue;
82                 done.add(p);
83                 p.recomputeFundamentalQuadric();
84             }
85     }
86     public float applyQuadricToNeighborAll() {
87         int num = 0;
88         double dist = 0;
89         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
90         for(T t : this)
91             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
92                 if (done.contains(p)) continue;
93                 done.add(p);
94                 p.applyQuadricToNeighbor();
95                 
96             }
97         return (float)(dist/num);
98     }
99
100     public void transform(Matrix m) {
101         ArrayList<Vert> set = new ArrayList<Vert>();
102         for (Vert v : pointset)
103             set.add(v);
104         for(Vert v : set) v.transform(m);
105     }
106
107     public float volume() {
108         double total = 0;
109         for(T t : this) {
110             double area = t.area();
111             Vec origin_to_centroid = new Vec(new Point(0, 0, 0), t.centroid());
112             boolean facingAway = t.norm().dot(origin_to_centroid) > 0;
113             double height = Math.abs(t.norm().dot(origin_to_centroid));
114             total += ((facingAway ? 1 : -1) * area * height) / 3.0;
115         }
116         return (float)total;
117     }
118
119     public void rebuildPointSet() { pointset.rebuild(); }
120     public Vec diagonal() { return pointset.diagonal(); }
121     public Point centroid() { return pointset.centroid(); }
122     public Vert nearest(Point p) { return pointset.nearest(p); }
123
124     public final class Vert extends HasPoint {
125         public Point p;
126         E e;                // some edge *leaving* this point
127
128         /** the nearest vertex in the "score_against" mesh */
129         Vert   nearest_in_other_mesh;
130         /** the number of vertices in the other mesh for which this is the nearest_in_other_mesh */
131         int    quadric_count;
132         /** the total error quadric (contributions from all vertices in other mesh for which this is nearest) */
133         Matrix quadric = Matrix.ZERO;
134
135         Vert bound_to = this;
136         Matrix binding = new Matrix();
137         float oldscore = 0;
138         boolean quadricStale = false;
139
140         public Matrix errorQuadric() { return quadric; }
141         public Point getPoint() { return p; }
142         public float score() { return oldscore; }
143
144         private Matrix fundamentalQuadric = null;
145         public Matrix fundamentalQuadric() {
146             if (fundamentalQuadric == null) recomputeFundamentalQuadric();
147             return fundamentalQuadric;
148         }
149
150         private Vert(Point p) {
151             this.p = p;
152             if (pointset.get(p) != null) throw new Error();
153             pointset.add(this);
154         }
155
156         public void recomputeFundamentalQuadric() {
157             if (!quadricStale && fundamentalQuadric != null) return;
158             quadricStale = false;
159             unApplyQuadricToNeighbor();
160             Matrix m = Matrix.ZERO;
161             E e = this.e;
162             do {
163                 T t = e.t;
164                 m = m.plus(t.norm().fundamentalQuadric(t.centroid()));
165                 e = e.pair.next;
166             } while(e != this.e);
167             fundamentalQuadric = m;
168             applyQuadricToNeighbor();
169         }
170
171         public void unApplyQuadricToNeighbor() {
172             if (nearest_in_other_mesh == null) return;
173             if (fundamentalQuadric == null) return;
174             nearest_in_other_mesh.unComputeError();
175             nearest_in_other_mesh.quadric = nearest_in_other_mesh.quadric.minus(fundamentalQuadric);
176             nearest_in_other_mesh.quadric_count--;
177             if (nearest_in_other_mesh.quadric_count==0)
178                 nearest_in_other_mesh.quadric = Matrix.ZERO;
179             nearest_in_other_mesh.computeError();
180             nearest_in_other_mesh = null;
181         }
182
183         public void applyQuadricToNeighbor() {
184             if (score_against == null) return;
185
186             Vert new_nearest = score_against.nearest(p);
187             if (nearest_in_other_mesh != null && new_nearest == nearest_in_other_mesh) return;
188
189             if (nearest_in_other_mesh != null) unApplyQuadricToNeighbor();
190             if (nearest_in_other_mesh != null) throw new Error();
191
192             nearest_in_other_mesh = new_nearest;
193                 
194             // don't attract to vertices that face the other way
195             if (nearest_in_other_mesh.e == null || nearest_in_other_mesh.norm().dot(norm()) < 0) {
196                 nearest_in_other_mesh = null;
197             } else {
198                 nearest_in_other_mesh.unComputeError();
199                 nearest_in_other_mesh.quadric = nearest_in_other_mesh.quadric.plus(fundamentalQuadric());
200                 nearest_in_other_mesh.quadric_count++;
201                 nearest_in_other_mesh.computeError();
202             }
203             reComputeError();
204         }
205
206         public void reComputeError() {
207             unComputeError();
208             computeError();
209         }
210         public void unComputeError() {
211             score -= oldscore;
212             oldscore = 0;
213         }
214         public void computeError() {
215             oldscore = quadric_count == 0 ? 0 : (quadric.preAndPostMultiply(p) / quadric_count);
216             score += oldscore;
217         }
218
219         /** does NOT update bound pairs! */
220         public boolean transform(Matrix m) {
221             unApplyQuadricToNeighbor();
222             try {
223                 if (pointset.get(this.p)==null) throw new Error();
224                 pointset.remove(this);
225                 float newx = m.a*p.x + m.b*p.y + m.c*p.z + m.d;
226                 float newy = m.e*p.x + m.f*p.y + m.g*p.z + m.h;
227                 float newz = m.i*p.x + m.j*p.y + m.k*p.z + m.l;
228                 this.p = new Point(newx, newy, newz);
229                 pointset.add(this);
230             } catch (Exception e) {
231                 throw new RuntimeException(e);
232             }
233             applyQuadricToNeighbor();
234
235             // should recompute fundamental quadrics of all vertices sharing a face, but we defer...
236             E e = this.e;
237             do {
238                 e.p2.quadricStale = true;
239                 e = e.pair.next;
240             } while(e != this.e);
241
242
243             // FIXME: intersection test needed?
244             return true;
245         }
246
247         public boolean move(Vec v) {
248             Matrix m = new Matrix(v);
249             Vert p = this;
250             boolean good = true;
251             do {
252                 good &= p.transform(m);
253                 p = p.bound_to;
254             } while (p != this);
255             return good;
256         }
257
258         public E getFreeIncident() {
259             E ret = getFreeIncident(e, e);
260             if (ret != null) return ret;
261             ret = getFreeIncident(e.pair.next, e.pair.next);
262             if (ret == null) throw new Error("unable to find free incident to " + this);
263             return ret;
264         }
265
266         public E getFreeIncident(E start, E before) {
267             E e = start;
268             do {
269                 if (e.pair.p2 == this && e.pair.t == null && e.pair.next.t == null) return e.pair;
270                 e = e.pair.next;
271             } while(e != before);
272             return null;
273         }
274
275         public E getE(Point p2) {
276             Vert v = pointset.get(p2);
277             if (v==null) return null;
278             return getE(v);
279         }
280         public E getE(Vert p2) {
281             E e = this.e;
282             do {
283                 if (e==null) return null;
284                 if (e.p1 == this && e.p2 == p2) return e;
285                 e = e.pair.next;
286             } while (e!=this.e);
287             return null;
288         }
289
290         public Vec norm() {
291             Vec norm = new Vec(0, 0, 0);
292             E e = this.e;
293             do {
294                 if (e.t != null) norm = norm.plus(e.t.norm().times((float)e.prev.angle()));
295                 e = e.pair.next;
296             } while(e != this.e);
297             return norm.norm();
298         }
299
300         public boolean isBoundTo(Vert p) {
301             Vert px = p;
302             do {
303                 if (px==this) return true;
304                 px = px.bound_to;
305             } while(px != p);
306             return false;
307         }
308         public void unbind() { bound_to = this; binding = new Matrix(); }
309         public void bind(Vert p) { bind(p, new Matrix()); }
310         public void bind(Vert p, Matrix binding) {
311             if (isBoundTo(p)) return;
312             Vert temp_bound_to = p.bound_to;
313             Matrix temp_binding = p.binding;
314             p.bound_to = this.bound_to;
315             p.binding = binding.times(this.binding); // FIXME: may have order wrong here
316             this.bound_to = temp_bound_to;
317             this.binding = temp_binding.times(temp_binding); // FIXME: may have order wrong here
318         }
319     }
320
321     public class BindingGroup {
322         private HashSet<E> ess = new HashSet<E>();
323         public BindingGroup() { }
324         public BindingGroup(E e) {
325             ess.add(e);
326         }
327         public void add(E e) {
328             if (e.bg != null) {
329                 for(E ex : e.bg.ess) {
330                     ex.bg = null;
331                     add(ex);
332                 }
333             } else {
334                 ess.add(e);
335                 e.bg = this;
336             }
337         }
338         public void dobind(E e) {
339             for(E ex : ess) {
340                 if (ex==e) continue;
341                 e.p1.bind(ex.p1);
342                 e.p2.bind(ex.p2);
343             }
344         }
345         public void shatter(BindingGroup bg1, BindingGroup bg2) {
346             for(E e : ess) {
347                 e.shatter(e.midpoint(), bg1, bg2);
348             }
349         }
350     }
351
352     /** [UNIQUE] an edge */
353     public final class E implements Comparable<E> {
354
355         public final Vert p1, p2;
356         T t;     // triangle to our "left"
357         E prev;  // previous half-edge
358         E next;  // next half-edge
359         E pair;  // partner half-edge
360         public BindingGroup bg = new BindingGroup(this);
361         boolean shattered = false;
362
363         public int compareTo(E e) { return e.length() > length() ? 1 : -1; }
364
365         public void bindEdge(E e) {
366             e.pair.bg.add(this);
367         }
368         public void dobind() { if (bg != null) bg.dobind(this); }
369
370         public Point shatter() { return shatter(midpoint(), null, null); }
371         public Point shatter(Point mid, BindingGroup bg1, BindingGroup bg2) {
372             if (shattered) return mid;
373             shattered = true;
374
375             Vert r = next.p2;
376             E next = this.next;
377             E prev = this.prev;
378
379             if (bg1==null) bg1 = new BindingGroup();
380             if (bg2==null) bg2 = new BindingGroup();
381             bg.shatter(bg1, bg2);
382             pair.shatter();
383             destroy();
384
385             newT(r.p, p1.p, mid, null);
386             newT(r.p, mid, p2.p, null);
387             bg1.add(p1.getE(mid));
388             bg2.add(p2.getE(mid).pair);
389             return mid;
390         }
391
392         public boolean destroyed = false;
393         public void destroy() {
394             if (destroyed) return;
395             destroyed = true;
396             pair.destroyed = true;
397             if (next.t != null) next.t.destroy();
398             if (prev.t != null) prev.t.destroy();
399             next.t = null;
400             prev.t = null;
401             pair.next.t = null;
402             pair.prev.t = null;
403             this.bg = null;
404             pair.bg = null;
405             pair.prev.next = next;
406             next.prev = pair.prev;
407             prev.next = pair.next;
408             pair.next = prev;
409             if (p1.e == this) p1.e = prev.next;
410             if (pair.p1.e == pair) pair.p1.e = pair.prev.next;
411             avgedge -= this.length();
412             avgedge -= pair.length();
413             numedges--;
414             numedges--;
415         }
416
417         private void sync() {
418             this.prev.next = this;
419             this.next.prev = this;
420             this.pair.pair = this;
421             if (this.next.p1 != p2) throw new Error();
422             if (this.prev.p2 != p1) throw new Error();
423             if (this.p1.e == null) this.p1.e = this;
424             if (!added) {
425                 added = true;
426                 numedges++;
427                 avgedge += length();
428             }
429         }
430         private boolean added = false;
431
432         public T makeT() { return t==null ? (t = new T(this)) : t; }
433
434         /** angle between this half-edge and the next */
435         public double angle() {
436             Vec v1 = next.p2.p.minus(p2.p);
437             Vec v2 = this.p1.p.minus(p2.p);
438             return Math.acos(v1.norm().dot(v2.norm()));
439         }
440
441         public void makeAdjacent(E e) {
442             if (this.next == e) return;
443             if (p2 != e.p1) throw new Error("cannot make adjacent -- no shared vertex");
444             if (t != null || e.t != null) throw new Error("cannot make adjacent -- edges not both free");
445
446             E freeIncident = p2.getFreeIncident(e, this);
447
448             e.prev.next = freeIncident.next;
449             freeIncident.next.prev = e.prev;
450
451             freeIncident.next = this.next;
452             this.next.prev = freeIncident;
453             
454             this.next = e;
455             e.prev = this;
456
457             sync();
458             freeIncident.sync();
459         }
460
461         /** creates an isolated edge out in the middle of space */
462         public E(Point p1, Point p2) {
463             if (pointset.get(p1) != null) throw new Error();
464             if (pointset.get(p2) != null) throw new Error();
465             this.p1 = new Vert(p1);
466             this.p2 = new Vert(p2);
467             this.prev = this.next = this.pair = new E(this, this, this);
468             this.p1.e = this;
469             this.p2.e = this.pair;
470             sync();
471         }
472
473         /** adds a new half-edge from prev.p2 to p2 */
474         public E(E prev, Point p) {
475             Vert p2;
476             p2 = pointset.get(p);
477             if (p2 == null) p2 = new Vert(p);
478             this.p1 = prev.p2;
479             this.p2 = p2;
480             this.prev = prev;
481             if (p2.getE(p1) != null) throw new Error();
482             if (p2.e==null) {
483                 this.next = this.pair = new E(this, this, prev.next);
484             } else {
485                 E q = p2.getFreeIncident();
486                 this.next = q.next;
487                 this.next.prev = this;
488                 E z = prev.next;
489                 this.prev.next = this;
490                 this.pair = new E(q, this, z);
491             }
492             if (p2.e==null) p2.e = this.pair;
493             sync();
494         }
495
496         /** adds a new half-edge to the mesh with a given predecessor, successor, and pair */
497         public E(E prev, E pair, E next) {
498             this.p1 = prev.p2;
499             this.p2 = next.p1;
500             this.prev = prev;
501             this.next = next;
502             this.pair = pair;
503             sync();
504         }
505         public Point midpoint() { return new Point((p1.p.x+p2.p.x)/2, (p1.p.y+p2.p.y)/2, (p1.p.z+p2.p.z)/2); }
506         public boolean has(Vert v) { return v==p1 || v==p2; }
507         public float length() { return p1.p.minus(p2.p).mag(); }
508         public String toString() { return p1+"->"+p2; }
509
510         public boolean intersects(T t) {
511             double A0=t.v1().p.x, A1=t.v1().p.y, A2=t.v1().p.z;
512             double B0=t.v2().p.x, B1=t.v2().p.y, B2=t.v2().p.z;
513             double C0=t.v3().p.x, C1=t.v3().p.y, C2=t.v3().p.z;
514             double j0=p1.p.x, j1=p1.p.y, j2=p1.p.z;
515             double k0=p2.p.x, k1=p2.p.y, k2=p2.p.z;
516             double J0, J1, J2;
517             double K0, K1, K2;
518             double i0, i1, i2;
519             double a0, a1, a2;
520             double b0, b1, b2;
521             double c0, c1, c2;
522             double in_det;
523             double R00, R01, R02, R03,
524                 R10, R11, R12, R13,
525                 R20, R21, R22, R23,
526                 R30, R31, R32, R33;
527
528
529             /* a = B - A */
530             a0 = B0 - A0; 
531             a1 = B1 - A1; 
532             a2 = B2 - A2;
533             /* b = C - B */
534             b0 = C0 - A0;
535             b1 = C1 - A1;
536             b2 = C2 - A2;
537             /* c = a &times; b */
538             c0 = a1 * b2 - a2 * b1;
539             c1 = a2 * b0 - a0 * b2;
540             c2 = a0 * b1 - a1 * b0;
541  
542             /* M^(-1) = (1/det(M)) * adj(M) */
543             in_det = 1 / (c0 * c0 + c1 * c1 + c2 * c2);
544             R00 = (b1 * c2 - b2 * c1) * in_det;
545             R01 = (b2 * c0 - b0 * c2) * in_det;
546             R02 = (b0 * c1 - b1 * c0) * in_det;
547             R10 = (c1 * a2 - c2 * a1) * in_det;
548             R11 = (c2 * a0 - c0 * a2) * in_det;
549             R12 = (c0 * a1 - c1 * a0) * in_det;
550             R20 = (c0) * in_det;
551             R21 = (c1) * in_det;
552             R22 = (c2) * in_det;
553   
554             /* O = M^(-1) * A */
555             R03 = -(R00 * A0 + R01 * A1 + R02 * A2);
556             R13 = -(R10 * A0 + R11 * A1 + R12 * A2);
557             R23 = -(R20 * A0 + R21 * A1 + R22 * A2);
558  
559             /* fill in last row of 4x4 matrix */
560             R30 = R31 = R32 = 0;
561             R33 = 1;
562   
563             J2 = R20 * j0 + R21 * j1 + R22 * j2 + R23;
564             K2 = R20 * k0 + R21 * k1 + R22 * k2 + R23;
565             if (J2 * K2 >= 0) return false;
566
567             J0 = R00 * j0 + R01 * j1 + R02 * j2 + R03;
568             K0 = R00 * k0 + R01 * k1 + R02 * k2 + R03;
569             i0 = J0 + J2 * ((K0 - J0) / (J2 - K2));
570             if (i0 < 0 || i0 > 1) return false;
571   
572             J1 = R10 * j0 + R11 * j1 + R12 * j2 + R13;
573             K1 = R10 * k0 + R11 * k1 + R12 * k2 + R13;
574             i1 = J1 + J2 * ((K1 - J1) / (J2 - K2));
575             if (i1 < 0 || i1 > 1 || i0 + i1 > 1) return false;
576
577             return true;            
578         }
579     }
580
581     public E makeE(Point p1, Point p2) {
582         Vert v1 = pointset.get(p1);
583         Vert v2 = pointset.get(p2);
584         if (v1 != null && v2 != null) {
585             E e = v1.getE(v2);
586             if (e != null) return e;
587             e = v2.getE(v1);
588             if (e != null) return e;
589         }
590         if (v1 != null) return new E(v1.getFreeIncident(), p2);
591         if (v2 != null) return new E(v2.getFreeIncident(), p1).pair;
592         return new E(p1, p2);
593     }
594     public T newT(Point p1, Point p2, Point p3, Vec norm) {
595         if (norm != null) {
596             Vec norm2 = p3.minus(p1).cross(p2.minus(p1));
597             float dot = norm.dot(norm2);
598             //if (Math.abs(dot) < EPointSILON) throw new Error("dot products within evertsilon of each other: "+norm+" "+norm2);
599             if (dot < 0) { Point p = p1; p1=p2; p2 = p; }
600         }
601         E e12 = makeE(p1, p2);
602         E e23 = makeE(p2, p3);
603         E e31 = makeE(p3, p1);
604         while(e12.next != e23 || e23.next != e31 || e31.next != e12) {
605             e12.makeAdjacent(e23);
606             e23.makeAdjacent(e31);
607             e31.makeAdjacent(e12);
608         }
609         T ret = e12.makeT();
610         if (e12.t == null) throw new Error();
611         if (e23.t == null) throw new Error();
612         if (e31.t == null) throw new Error();
613         return ret;
614     }
615
616
617     public class FaceIterator implements Iterator<T> {
618         private HashSet<T> visited = new HashSet<T>();
619         private LinkedList<T> next = new LinkedList<T>();
620         public FaceIterator() { }
621         public FaceIterator(Vert v) { next.addFirst(v.e.t); }
622         public boolean hasNext() { return next.peek()!=null; }
623         public void remove() { throw new Error(); }
624         public T next() {
625             T ret = next.removeFirst();
626             if (ret == null) return null;
627             visited.add(ret);
628             T t1 = ret.e1().pair.t;
629             T t2 = ret.e2().pair.t;
630             T t3 = ret.e3().pair.t;
631             if (t1 != null && !visited.contains(t1)) next.addFirst(t1);
632             if (t2 != null && !visited.contains(t2)) next.addFirst(t2);
633             if (t3 != null && !visited.contains(t3)) next.addFirst(t3);
634             return ret;
635         }
636     }
637
638     /** [UNIQUE] a triangle (face) */
639     public final class T extends Triangle {
640         public final E e1;
641         public final int color;
642
643         public void destroy() {
644         }
645
646         T(E e1) {
647             this.e1 = e1;
648             E e2 = e1.next;
649             E e3 = e2.next;
650             if (e1==e2 || e1==e3) throw new Error();
651             if (e3.next!=e1) throw new Error();
652             if (e1.t!=null || e2.t!=null || e3.t!=null) throw new Error("non-manifold surface or disagreeing normals");
653             e1.t = this;
654             e1.next.t = this;
655             e1.next.next.t = this;
656
657             // FIXME: check for sealed/watertight surface once construction is complete (and infer normal(s)?)
658
659             int color = Math.abs(random.nextInt());
660             while(true) {
661                 color = color % 4;
662                 if (e1().pair.t != null && color == e1().pair.t.color) { color++; continue; }
663                 if (e2().pair.t != null && color == e2().pair.t.color) { color++; continue; }
664                 if (e3().pair.t != null && color == e3().pair.t.color) { color++; continue; }
665                 break;
666             }
667             this.color = color;
668         }
669         public E e1() { return e1; }
670         public E e2() { return e1.next; }
671         public E e3() { return e1.prev; }
672         public Vert v1() { return e1.p1; }
673         public Vert v2() { return e1.p2; }
674         public Vert v3() { return e1.next.p2; }
675         public Point p1() { return e1.p1.p; }
676         public Point p2() { return e1.p2.p; }
677         public Point p3() { return e1.next.p2.p; }
678         public boolean hasE(E e) { return e1==e || e1.next==e || e1.prev==e; }
679         public boolean has(Vert v) { return v1()==v || v2()==v || v3()==v; }
680     }
681
682 }