checkpoint
[anneal.git] / src / edu / berkeley / qfat / Mesh.java
1 package edu.berkeley.qfat;
2 import java.awt.*;
3 import java.util.*;
4 import java.awt.event.*;
5 import javax.swing.*;
6 import javax.media.opengl.*;
7 import javax.media.opengl.glu.*;
8 import edu.berkeley.qfat.geom.*;
9 import edu.wlu.cs.levy.CG.KDTree;
10 import edu.berkeley.qfat.geom.Point;
11
12 public class Mesh implements Iterable<Mesh.T> {
13
14     public static final float EPSILON = (float)0.0001;
15     public static final Random random = new Random();
16
17     private PointSet<Vert> pointset = new PointSet<Vert>();
18
19     public Iterable<Vert> vertices() { return pointset; }
20
21     public Iterable<E> edges() {
22         return
23             new Iterable<E>() {
24             public Iterator<E> iterator() {
25                 // HACK
26                 HashSet<E> hse = new HashSet<E>();
27                 for(T t : Mesh.this) {
28                     hse.add(t.e1());
29                     hse.add(t.e2());
30                     hse.add(t.e3());
31                     hse.add(t.e1().pair);
32                     hse.add(t.e2().pair);
33                     hse.add(t.e3().pair);
34                 }
35                 return hse.iterator();
36             } };
37     }
38
39     public Iterator<T> iterator() {
40         for(Vert v : pointset)
41             if (v.e != null && v.e.t != null)
42                 return new FaceIterator(v);
43         return new FaceIterator();
44     }
45
46     public Mesh score_against = null;
47     public double score = 0;
48     public float score() { return (float)score; }
49
50     public int numedges = 0;
51     public float avgedge = 0;
52
53     public void rebindPoints() {
54         // unbind all points
55         for(Mesh.T t : this) {
56             t.v1().unbind();
57             t.v2().unbind();
58             t.v3().unbind();
59         }
60         // ask edges to re-implement their bindings
61         for(Mesh.T t : this) {
62             t.e1().dobind();
63             t.e2().dobind();
64             t.e3().dobind();
65         }
66     }
67
68     public void unApplyQuadricToNeighborAll() {
69         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
70         for(T t : this)
71             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
72                 if (done.contains(p)) continue;
73                 done.add(p);
74                 p.unApplyQuadricToNeighbor();
75             }
76     }
77     public void recomputeAllFundamentalQuadrics() {
78         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
79         for(T t : this)
80             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
81                 if (done.contains(p)) continue;
82                 done.add(p);
83                 p.recomputeFundamentalQuadric();
84             }
85     }
86     public float applyQuadricToNeighborAll() {
87         int num = 0;
88         double dist = 0;
89         HashSet<Vert> done = new HashSet<Vert>();
90         for(T t : this)
91             for(Vert p : new Vert[] { t.v1(), t.v2(), t.v3() }) {
92                 if (done.contains(p)) continue;
93                 done.add(p);
94                 p.applyQuadricToNeighbor();
95                 
96             }
97         return (float)(dist/num);
98     }
99
100     public void transform(Matrix m) {
101         ArrayList<Vert> set = new ArrayList<Vert>();
102         for (Vert v : pointset)
103             set.add(v);
104         for(Vert v : set) v.transform(m);
105     }
106
107     public float volume() {
108         double total = 0;
109         for(T t : this) {
110             double area = t.area();
111             Vec origin_to_centroid = new Vec(new Point(0, 0, 0), t.centroid());
112             boolean facingAway = t.norm().dot(origin_to_centroid) > 0;
113             double height = Math.abs(t.norm().dot(origin_to_centroid));
114             total += ((facingAway ? 1 : -1) * area * height) / 3.0;
115         }
116         return (float)total;
117     }
118
119     public class BindingGroup {
120         public HashSet<E> es = new HashSet<E>();
121         public BindingGroup() { }
122         public BindingGroup(E e) {
123             es.add(e);
124         }
125         public void add(E e) {
126             if (e.bg != null) { merge(e.bg); return; }
127             es.add(e);
128             e.bg = this;
129         }
130         public void merge(BindingGroup bg) {
131             for(E e : bg.es) {
132                 e.bg = null;
133                 add(e);
134             }
135         }
136     }
137
138     public Vec diagonal() { return pointset.diagonal(); }
139     public Point centroid() { return pointset.centroid(); }
140     public Vert nearest(Point p) { return pointset.nearest(p); }
141
142     public final class Vert extends HasPoint {
143         public Point p;
144         E e;                // some edge *leaving* this point
145
146         /** the nearest vertex in the "score_against" mesh */
147         Vert   nearest_in_other_mesh;
148         /** the number of vertices in the other mesh for which this is the nearest_in_other_mesh */
149         int    quadric_count;
150         /** the total error quadric (contributions from all vertices in other mesh for which this is nearest) */
151         Matrix quadric = Matrix.ZERO;
152
153         Vert bound_to = this;
154         Matrix binding = new Matrix();
155         float oldscore = 0;
156
157         public Matrix errorQuadric() { return quadric; }
158         public Point getPoint() { return p; }
159         public float score() { return oldscore; }
160
161         private Matrix fundamentalQuadric = null;
162         public Matrix fundamentalQuadric() {
163             if (fundamentalQuadric == null) recomputeFundamentalQuadric();
164             return fundamentalQuadric;
165         }
166
167         private Vert(Point p) {
168             this.p = p;
169             if (pointset.get(p) != null) throw new Error();
170             pointset.add(this);
171         }
172
173         public void recomputeFundamentalQuadric() {
174             unApplyQuadricToNeighbor();
175             Matrix m = Matrix.ZERO;
176             E e = this.e;
177             do {
178                 T t = e.t;
179                 m = m.plus(t.norm().fundamentalQuadric(t.centroid()));
180                 e = e.pair.next;
181             } while(e != this.e);
182             fundamentalQuadric = m;
183             applyQuadricToNeighbor();
184         }
185
186         public void unApplyQuadricToNeighbor() {
187             if (nearest_in_other_mesh == null) return;
188             if (fundamentalQuadric == null) return;
189             nearest_in_other_mesh.unsc();
190             nearest_in_other_mesh.quadric = nearest_in_other_mesh.quadric.minus(fundamentalQuadric);
191             nearest_in_other_mesh.quadric_count--;
192             if (nearest_in_other_mesh.quadric_count==0)
193                 nearest_in_other_mesh.quadric = Matrix.ZERO;
194             nearest_in_other_mesh.resc();
195             nearest_in_other_mesh = null;
196         }
197
198         public void unsc() {
199             score -= oldscore;
200             oldscore = 0;
201         }
202         public void applyQuadricToNeighbor() {
203             if (score_against == null) return;
204
205             if (nearest_in_other_mesh != null) unApplyQuadricToNeighbor();
206             if (nearest_in_other_mesh == null) {
207                 nearest_in_other_mesh = score_against.nearest(p);
208
209                 // don't attract to vertices that face the other way
210                 if (nearest_in_other_mesh.e == null || nearest_in_other_mesh.norm().dot(norm()) < 0) {
211                     nearest_in_other_mesh = null;
212                 } else {
213                     nearest_in_other_mesh.unsc();
214                     nearest_in_other_mesh.quadric = nearest_in_other_mesh.quadric.plus(fundamentalQuadric());
215                     nearest_in_other_mesh.quadric_count++;
216                     nearest_in_other_mesh.resc();
217                 }
218             }
219             unsc();
220             resc();
221         }
222         public void resc() {
223             oldscore = quadric_count == 0 ? 0 : (quadric.preAndPostMultiply(p) / quadric_count);
224             score += oldscore;
225         }
226
227         /** does NOT update bound pairs! */
228         public boolean transform(Matrix m) {
229             unApplyQuadricToNeighbor();
230             try {
231                 if (pointset.get(this.p)==null) throw new Error();
232                 pointset.remove(this);
233                 float newx = m.a*p.x + m.b*p.y + m.c*p.z + m.d;
234                 float newy = m.e*p.x + m.f*p.y + m.g*p.z + m.h;
235                 float newz = m.i*p.x + m.j*p.y + m.k*p.z + m.l;
236                 this.p = new Point(newx, newy, newz);
237                 pointset.add(this);
238             } catch (Exception e) {
239                 throw new RuntimeException(e);
240             }
241             applyQuadricToNeighbor();
242
243             // should recompute fundamental quadrics of all vertices sharing a face, but we defer...
244             // FIXME: intersection test needed?
245             return true;
246         }
247
248         public boolean move(Vec v) {
249             Matrix m = new Matrix(v);
250             Vert p = this;
251             boolean good = true;
252             do {
253                 good &= p.transform(m);
254                 p = p.bound_to;
255             } while (p != this);
256             return good;
257         }
258
259         public E getFreeIncident() {
260             E ret = getFreeIncident(e, e);
261             if (ret != null) return ret;
262             ret = getFreeIncident(e.pair.next, e.pair.next);
263             if (ret == null) throw new Error("unable to find free incident to " + this);
264             return ret;
265         }
266
267         public E getFreeIncident(E start, E before) {
268             E e = start;
269             do {
270                 if (e.pair.p2 == this && e.pair.t == null && e.pair.next.t == null) return e.pair;
271                 e = e.pair.next;
272             } while(e != before);
273             return null;
274         }
275
276         public E getE(Point p2) {
277             Vert v = pointset.get(p2);
278             if (v==null) return null;
279             return getE(v);
280         }
281         public E getE(Vert p2) {
282             E e = this.e;
283             do {
284                 if (e==null) return null;
285                 if (e.p1 == this && e.p2 == p2) return e;
286                 e = e.pair.next;
287             } while (e!=this.e);
288             return null;
289         }
290
291         public Vec norm() {
292             Vec norm = new Vec(0, 0, 0);
293             E e = this.e;
294             do {
295                 if (e.t != null) norm = norm.plus(e.t.norm().times((float)e.prev.angle()));
296                 e = e.pair.next;
297             } while(e != this.e);
298             return norm.norm();
299         }
300
301         public boolean isBoundTo(Vert p) {
302             Vert px = p;
303             do {
304                 if (px==this) return true;
305                 px = px.bound_to;
306             } while(px != p);
307             return false;
308         }
309         public void unbind() { bound_to = this; binding = new Matrix(); }
310         public void bind(Vert p) { bind(p, new Matrix()); }
311         public void bind(Vert p, Matrix binding) {
312             if (isBoundTo(p)) return;
313             Vert temp_bound_to = p.bound_to;
314             Matrix temp_binding = p.binding;
315             p.bound_to = this.bound_to;
316             p.binding = binding.times(this.binding); // FIXME: may have order wrong here
317             this.bound_to = temp_bound_to;
318             this.binding = temp_binding.times(temp_binding); // FIXME: may have order wrong here
319         }
320     }
321
322     /** [UNIQUE] an edge */
323     public final class E implements Comparable<E> {
324
325         public final Vert p1, p2;
326         T t;     // triangle to our "left"
327         E prev;  // previous half-edge
328         E next;  // next half-edge
329         E pair;  // partner half-edge
330         public BindingGroup bg = new BindingGroup(this);
331         boolean shattered = false;
332
333         public int compareTo(E e) { return e.length() > length() ? 1 : -1; }
334
335         public void bind(E e) { bind(e, new Matrix()); }
336         public void bind(E e, Matrix m) { e.bg.add(this); }
337
338         public void dobind() {
339             if (bg==null) return;
340             for(E ex : bg.es) {
341                 if (ex==this) continue;
342                 p1.bind(ex.p1);
343                 p2.bind(ex.p2);
344             }
345         }
346
347         public Point shatter() { return shatter(midpoint(), null, null); }
348         public Point shatter(Point mid, BindingGroup bg1, BindingGroup bg2) {
349             if (shattered) return mid;
350             shattered = true;
351
352             Vert r = next.p2;
353             E next = this.next;
354             E prev = this.prev;
355
356             if (bg1==null) bg1 = new BindingGroup();
357             if (bg2==null) bg2 = new BindingGroup();
358             for(E e : bg.es) e.shatter(e.midpoint(), bg1, bg2);
359             pair.shatter();
360             destroy();
361
362             newT(r.p, p1.p, mid, null);
363             newT(r.p, mid, p2.p, null);
364             bg1.add(p1.getE(mid));
365             bg2.add(p2.getE(mid).pair);
366             return mid;
367         }
368
369         public boolean destroyed = false;
370         public void destroy() {
371             if (destroyed) return;
372             destroyed = true;
373             pair.destroyed = true;
374             if (next.t != null) next.t.destroy();
375             if (prev.t != null) prev.t.destroy();
376             next.t = null;
377             prev.t = null;
378             pair.next.t = null;
379             pair.prev.t = null;
380             this.bg = null;
381             pair.bg = null;
382             pair.prev.next = next;
383             next.prev = pair.prev;
384             prev.next = pair.next;
385             pair.next = prev;
386             if (p1.e == this) p1.e = prev.next;
387             if (pair.p1.e == pair) pair.p1.e = pair.prev.next;
388             avgedge -= this.length();
389             avgedge -= pair.length();
390             numedges--;
391             numedges--;
392         }
393
394         private void sync() {
395             this.prev.next = this;
396             this.next.prev = this;
397             this.pair.pair = this;
398             if (this.next.p1 != p2) throw new Error();
399             if (this.prev.p2 != p1) throw new Error();
400             if (this.p1.e == null) this.p1.e = this;
401             if (!added) {
402                 added = true;
403                 numedges++;
404                 avgedge += length();
405             }
406         }
407         private boolean added = false;
408
409         public T makeT() { return t==null ? (t = new T(this)) : t; }
410
411         /** angle between this half-edge and the next */
412         public double angle() {
413             Vec v1 = next.p2.p.minus(p2.p);
414             Vec v2 = this.p1.p.minus(p2.p);
415             return Math.acos(v1.norm().dot(v2.norm()));
416         }
417
418         public void makeAdjacent(E e) {
419             if (this.next == e) return;
420             if (p2 != e.p1) throw new Error("cannot make adjacent -- no shared vertex");
421             if (t != null || e.t != null) throw new Error("cannot make adjacent -- edges not both free");
422
423             E freeIncident = p2.getFreeIncident(e, this);
424
425             e.prev.next = freeIncident.next;
426             freeIncident.next.prev = e.prev;
427
428             freeIncident.next = this.next;
429             this.next.prev = freeIncident;
430             
431             this.next = e;
432             e.prev = this;
433
434             sync();
435             freeIncident.sync();
436         }
437
438         /** creates an isolated edge out in the middle of space */
439         public E(Point p1, Point p2) {
440             if (pointset.get(p1) != null) throw new Error();
441             if (pointset.get(p2) != null) throw new Error();
442             this.p1 = new Vert(p1);
443             this.p2 = new Vert(p2);
444             this.prev = this.next = this.pair = new E(this, this, this);
445             this.p1.e = this;
446             this.p2.e = this.pair;
447             sync();
448         }
449
450         /** adds a new half-edge from prev.p2 to p2 */
451         public E(E prev, Point p) {
452             Vert p2;
453             p2 = pointset.get(p);
454             if (p2 == null) p2 = new Vert(p);
455             this.p1 = prev.p2;
456             this.p2 = p2;
457             this.prev = prev;
458             if (p2.getE(p1) != null) throw new Error();
459             if (p2.e==null) {
460                 this.next = this.pair = new E(this, this, prev.next);
461             } else {
462                 E q = p2.getFreeIncident();
463                 this.next = q.next;
464                 this.next.prev = this;
465                 E z = prev.next;
466                 this.prev.next = this;
467                 this.pair = new E(q, this, z);
468             }
469             if (p2.e==null) p2.e = this.pair;
470             sync();
471         }
472
473         /** adds a new half-edge to the mesh with a given predecessor, successor, and pair */
474         public E(E prev, E pair, E next) {
475             this.p1 = prev.p2;
476             this.p2 = next.p1;
477             this.prev = prev;
478             this.next = next;
479             this.pair = pair;
480             sync();
481         }
482         public Point midpoint() { return new Point((p1.p.x+p2.p.x)/2, (p1.p.y+p2.p.y)/2, (p1.p.z+p2.p.z)/2); }
483         public boolean has(Vert v) { return v==p1 || v==p2; }
484         public float length() { return p1.p.minus(p2.p).mag(); }
485         public String toString() { return p1+"->"+p2; }
486
487         public boolean intersects(T t) {
488             double A0=t.v1().p.x, A1=t.v1().p.y, A2=t.v1().p.z;
489             double B0=t.v2().p.x, B1=t.v2().p.y, B2=t.v2().p.z;
490             double C0=t.v3().p.x, C1=t.v3().p.y, C2=t.v3().p.z;
491             double j0=p1.p.x, j1=p1.p.y, j2=p1.p.z;
492             double k0=p2.p.x, k1=p2.p.y, k2=p2.p.z;
493             double J0, J1, J2;
494             double K0, K1, K2;
495             double i0, i1, i2;
496             double a0, a1, a2;
497             double b0, b1, b2;
498             double c0, c1, c2;
499             double in_det;
500             double R00, R01, R02, R03,
501                 R10, R11, R12, R13,
502                 R20, R21, R22, R23,
503                 R30, R31, R32, R33;
504
505
506             /* a = B - A */
507             a0 = B0 - A0; 
508             a1 = B1 - A1; 
509             a2 = B2 - A2;
510             /* b = C - B */
511             b0 = C0 - A0;
512             b1 = C1 - A1;
513             b2 = C2 - A2;
514             /* c = a &times; b */
515             c0 = a1 * b2 - a2 * b1;
516             c1 = a2 * b0 - a0 * b2;
517             c2 = a0 * b1 - a1 * b0;
518  
519             /* M^(-1) = (1/det(M)) * adj(M) */
520             in_det = 1 / (c0 * c0 + c1 * c1 + c2 * c2);
521             R00 = (b1 * c2 - b2 * c1) * in_det;
522             R01 = (b2 * c0 - b0 * c2) * in_det;
523             R02 = (b0 * c1 - b1 * c0) * in_det;
524             R10 = (c1 * a2 - c2 * a1) * in_det;
525             R11 = (c2 * a0 - c0 * a2) * in_det;
526             R12 = (c0 * a1 - c1 * a0) * in_det;
527             R20 = (c0) * in_det;
528             R21 = (c1) * in_det;
529             R22 = (c2) * in_det;
530   
531             /* O = M^(-1) * A */
532             R03 = -(R00 * A0 + R01 * A1 + R02 * A2);
533             R13 = -(R10 * A0 + R11 * A1 + R12 * A2);
534             R23 = -(R20 * A0 + R21 * A1 + R22 * A2);
535  
536             /* fill in last row of 4x4 matrix */
537             R30 = R31 = R32 = 0;
538             R33 = 1;
539   
540             J2 = R20 * j0 + R21 * j1 + R22 * j2 + R23;
541             K2 = R20 * k0 + R21 * k1 + R22 * k2 + R23;
542             if (J2 * K2 >= 0) return false;
543
544             J0 = R00 * j0 + R01 * j1 + R02 * j2 + R03;
545             K0 = R00 * k0 + R01 * k1 + R02 * k2 + R03;
546             i0 = J0 + J2 * ((K0 - J0) / (J2 - K2));
547             if (i0 < 0 || i0 > 1) return false;
548   
549             J1 = R10 * j0 + R11 * j1 + R12 * j2 + R13;
550             K1 = R10 * k0 + R11 * k1 + R12 * k2 + R13;
551             i1 = J1 + J2 * ((K1 - J1) / (J2 - K2));
552             if (i1 < 0 || i1 > 1 || i0 + i1 > 1) return false;
553
554             return true;            
555         }
556     }
557
558     public E makeE(Point p1, Point p2) {
559         Vert v1 = pointset.get(p1);
560         Vert v2 = pointset.get(p2);
561         if (v1 != null && v2 != null) {
562             E e = v1.getE(v2);
563             if (e != null) return e;
564             e = v2.getE(v1);
565             if (e != null) return e;
566         }
567         if (v1 != null) return new E(v1.getFreeIncident(), p2);
568         if (v2 != null) return new E(v2.getFreeIncident(), p1).pair;
569         return new E(p1, p2);
570     }
571     public T newT(Point p1, Point p2, Point p3, Vec norm) {
572         if (norm != null) {
573             Vec norm2 = p3.minus(p1).cross(p2.minus(p1));
574             float dot = norm.dot(norm2);
575             //if (Math.abs(dot) < EPointSILON) throw new Error("dot products within evertsilon of each other: "+norm+" "+norm2);
576             if (dot < 0) { Point p = p1; p1=p2; p2 = p; }
577         }
578         E e12 = makeE(p1, p2);
579         E e23 = makeE(p2, p3);
580         E e31 = makeE(p3, p1);
581         while(e12.next != e23 || e23.next != e31 || e31.next != e12) {
582             e12.makeAdjacent(e23);
583             e23.makeAdjacent(e31);
584             e31.makeAdjacent(e12);
585         }
586         T ret = e12.makeT();
587         if (e12.t == null) throw new Error();
588         if (e23.t == null) throw new Error();
589         if (e31.t == null) throw new Error();
590         return ret;
591     }
592
593
594     public class FaceIterator implements Iterator<T> {
595         private HashSet<T> visited = new HashSet<T>();
596         private LinkedList<T> next = new LinkedList<T>();
597         public FaceIterator() { }
598         public FaceIterator(Vert v) { next.addFirst(v.e.t); }
599         public boolean hasNext() { return next.peek()!=null; }
600         public void remove() { throw new Error(); }
601         public T next() {
602             T ret = next.removeFirst();
603             if (ret == null) return null;
604             visited.add(ret);
605             T t1 = ret.e1().pair.t;
606             T t2 = ret.e2().pair.t;
607             T t3 = ret.e3().pair.t;
608             if (t1 != null && !visited.contains(t1)) next.addFirst(t1);
609             if (t2 != null && !visited.contains(t2)) next.addFirst(t2);
610             if (t3 != null && !visited.contains(t3)) next.addFirst(t3);
611             return ret;
612         }
613     }
614
615     /** [UNIQUE] a triangle (face) */
616     public final class T extends Triangle {
617         public final E e1;
618         public final int color;
619
620         public void destroy() {
621         }
622
623         T(E e1) {
624             this.e1 = e1;
625             E e2 = e1.next;
626             E e3 = e2.next;
627             if (e1==e2 || e1==e3) throw new Error();
628             if (e3.next!=e1) throw new Error();
629             if (e1.t!=null || e2.t!=null || e3.t!=null) throw new Error("non-manifold surface or disagreeing normals");
630             e1.t = this;
631             e1.next.t = this;
632             e1.next.next.t = this;
633
634             // FIXME: check for sealed/watertight surface once construction is complete (and infer normal(s)?)
635
636             int color = Math.abs(random.nextInt());
637             while(true) {
638                 color = color % 4;
639                 if (e1().pair.t != null && color == e1().pair.t.color) { color++; continue; }
640                 if (e2().pair.t != null && color == e2().pair.t.color) { color++; continue; }
641                 if (e3().pair.t != null && color == e3().pair.t.color) { color++; continue; }
642                 break;
643             }
644             this.color = color;
645         }
646         public E e1() { return e1; }
647         public E e2() { return e1.next; }
648         public E e3() { return e1.prev; }
649         public Vert v1() { return e1.p1; }
650         public Vert v2() { return e1.p2; }
651         public Vert v3() { return e1.next.p2; }
652         public Point p1() { return e1.p1.p; }
653         public Point p2() { return e1.p2.p; }
654         public Point p3() { return e1.next.p2.p; }
655         public boolean hasE(E e) { return e1==e || e1.next==e || e1.prev==e; }
656         public boolean has(Vert v) { return v1()==v || v2()==v || v3()==v; }
657     }
658
659 }